生物信息


EasyArray - 简单的microarray差异分析平台

折腾了一天,终于搞出来了。

发布日期:2020-10-13

2020-10-13
#TCGA系列#TCGA临床数据整理

TCGA数据获取、处理和分析流程(三)

发布日期:2020-10-23

2020-10-23
TCGA数据库中应该下载哪种表达量数据HTSeq-Counts,HTSeq-FPKM,HTSeq-FPKM-UQ

TCGA数据库中应该下载哪种表达量数据HTSeq-Counts,HTSeq-FPKM,HTSeq-FPKM-UQ

发布日期:2021-10-30

2021-10-30
#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表达谱数据整合

TCGA数据获取、处理和分析流程(二)

发布日期:2020-10-10

2020-10-10
TCGAbiolinks安装踩坑记录

安装TCGAbiolinks一直失败,报错依赖包“purrrogress”不存在,该怎么办?

发布日期:2021-11-10

2021-11-10
ESTIMATE计算肿瘤免疫得分

记录一下如何用R中的ESTIMATE包计算肿瘤的免疫和间质得分

发布日期:2021-11-12

2021-11-12
【转】StandardScaler/MinMaxScaler/Normalizer之间的区别

转载一个sklearn中三个不同数据预处理方法的比较。

发布日期:2022-12-30

2022-12-30
#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表达谱及临床数据下载

TCGA数据获取、处理和分析流程(一)

发布日期:2020-10-03

2020-10-03
【转载】COX回归理解与案例

在常见的生信套路文中,我们经常会看到作者使用cox回归对一些差异表达的基因进行筛选,进一步缩小后续建模用到的基因list。但该方法背后的原理是什么,我一直没有去深入研究。今天看到一篇还算通俗易懂的解释,就转载做个记录。

发布日期:2023-02-07

2023-02-07
R语言花式作图 - 如何将样本的采样情况可视化?

复现一篇nature cancer中的一个小图,很简单,不过如果不太熟悉ggplot和R的多图拼接的话,也着实需要花一番功夫。

发布日期:2023-03-29

2023-03-29

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